空間產品
通過采用尖端的空間技術，能夠在保持細胞原始空間位置的同時，精確分析和可視化基因表達和蛋白標記等，深入研究組織微環(huán)境中的細胞互作。
10x Genomics空間轉錄組（含Visium HD）
將基因空間表達可視化，在識別不同細胞群的同時保留空間背景，提供了關于組織微環(huán)境中細胞功能、表型和位置關系的關鍵信息。
Stereo-seq空間轉錄組
該技術通過時空芯片捕獲組織中的 mRNA，并通過空間條形碼（Coordinate ID，CID）還原回空間位置實現組織原位測序，為深入地了解細胞的基因表達及形態(tài)與局部環(huán)境之間的關系建立強大的研究基礎。
Akoya空間蛋白組
可提供同時檢測幾種（PhenoImager Fusion）到100多種（PhenoCycler-Fusion）生物蛋白標志物的解決方案，準確定位細胞空間分布、判斷細胞行為、識別不同的細胞聚集模式，實現組織原位超多靶點蛋白標記分析。
應用方向
- 腫瘤及免疫研究：有助于識別腫瘤微環(huán)境中的細胞相互作用，以及免疫細胞在腫瘤進展和治療反應中的角色；
- 病理學研究：通過在組織切片上進行高分辨率的分子表達分析，有助于揭示疾病的分子機制和組織中的病理變化；
- 發(fā)育生物學：通過分析發(fā)育過程中細胞在空間上的分布和基因表達變化，揭示細胞分化和組織形態(tài)形成的動態(tài)過程；
- 空間圖譜：構建器官和組織的空間圖譜，展示細胞在特定生理和病理狀態(tài)下的空間分布和相互作用，這對于理解復雜生物系統(tǒng)的結構和功能至關重要；
- 生物標志物挖掘：通過分析細胞在特定組織環(huán)境中的表達模式，可以識別與疾病進程、治療響應或預后相關的關鍵分子標志物；
案例解析
頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC)腫瘤微環(huán)境空間激活途徑
單細胞聯合空間轉錄組揭示頭頸鱗狀細胞癌腫瘤微環(huán)境中增殖型耗竭CD8+T細胞作用
該研究利用單細胞水平的多組學技術構建了人頭頸鱗狀細胞癌的多維度腫瘤微環(huán)境圖譜，從中鑒定出了一群具有增殖潛能并能持續(xù)發(fā)揮抗瘤效應的新增殖型耗竭CD8+T細胞，并深入解析了其在腫瘤微環(huán)境中的作用機制。本研究系統(tǒng)性地解析了頭頸鱗狀細胞癌微環(huán)境中增殖型耗蝎CDB+T細胞的多維度特征，證實了其豐度與HPV陽性頭頸鮮狀細胞癌患者預后間的關聯性，以耗竭CD8+T細胞異質性為切入點，為HPV感染狀態(tài)如何影響CDK4抑制劑對頭頸鮮狀細胞癌的療效提供了新的解釋，有助于推動頭頸鮮狀細胞癌精準治療的進一步發(fā)展。
參考文獻：Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.
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